Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxp3Q99JB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms