Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NMD3Q96D46 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms