Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
SptssbQ925E8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms