Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mthfd1Q922D8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mthfd1Q922D8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms