Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Uhrf1Q8VDF2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uhrf1Q8VDF2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms