Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ClmpQ8R373 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms