Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp20Q8C6M1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms