Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp1Q8BJQ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp1Q8BJQ2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms