Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arhgef39Q66JY6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Arhgef39Q66JY6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Arhgef39Q66JY6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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