Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Zfp248Q640N4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Zfp248Q640N4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Zfp248Q640N4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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