Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ift20Q61025 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms