Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc42Q5SV66 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms