Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trdv2-2Q5R1A4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms