Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccnl1Q52KE7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccnl1Q52KE7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms