Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smim26Q3V460 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms