Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr1d1Q3UV55 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr1d1Q3UV55 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms