Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmem253Q3UNB8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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