Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trafd1Q3UDK1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trafd1Q3UDK1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms