Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp13a5Q3TYU2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms