Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ttc39dQ0VF76 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms