Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Igsf9Q05BQ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Igsf9Q05BQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Igsf9Q05BQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Igsf9Q05BQ1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms