Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Psmb4P99026 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms