Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ldb1P70662 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ldb1P70662 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ldb1P70662 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ldb1P70662 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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