Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmnb2P21619 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms