Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ChkaO54804 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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