Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm8005F6YKY3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms