Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol6B7ZC55 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol6B7ZC55 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms