Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ssxb8B1AY40 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssxb8B1AY40 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms