Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm11127A7VMS2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm11127A7VMS2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms