Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tubb1A2AQ07 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb1A2AQ07 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms