Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd1Q9Z2E2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms