Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tulp1Q9Z273 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tulp1Q9Z273 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms