Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn8Q9Z260 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn8Q9Z260 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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