Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRPF3Q9ULD4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms