Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubb4aQ9D6F9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubb4aQ9D6F9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms