Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UvssaQ9D479 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UvssaQ9D479 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms