Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snf8Q9CZ28 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snf8Q9CZ28 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms