Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MINDY3Q9CV28 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms