Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smurf1Q9CUN6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smurf1Q9CUN6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms