Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Lhfpl3Q9CTN8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms