Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
4921530L21RikQ9CQ47 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4921530L21RikQ9CQ47 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms