Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx18Q8VDS8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx18Q8VDS8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms