Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rd3Q8BRE0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rd3Q8BRE0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms