Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prpf18Q8BM39 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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