Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a9Q8BGD6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a9Q8BGD6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms