Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrp12Q6P5B0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms