Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt40Q6IFX3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt40Q6IFX3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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