Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85aQ5SP85 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc85aQ5SP85 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms