Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC37Q16543 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC37Q16543 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms