Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sox13Q04891 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sox13Q04891 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms